主人公朝仓陆有一天入手了捷德升华器与奥特胶囊，得到了FUSION RISE（融合上升）变身成捷德奥特曼的力。与此同时也知道自己继承了堕入邪恶的黑暗巨人贝利亚奥特曼的遗传基因。自己作为在地球长大的普通年轻人，知道了自己其实是贝利亚的儿子。捷德奥特曼，也就是朝仓陆的命运发生了巨大变化。