故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师黒羽盗一某日他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服于是他打算会见基德在那里他遇到了父亲过去的同伴寺井并得知父亲就是怪盗基德而且死因不是事故死而是他杀于是快斗为查出杀害父亲的犯人而自己成为了基德本作和名侦探柯南有不少共通点例如怪盗基德在两作中均有出现迷之组织的登场主人公真正身份不被世人所知等等感觉就像是融合了魔法元素的柯南