故事设定为迪迦消失后的第8年—2017年主人公飞鸟信的父亲飞鸟一马是在光中消失的宇航飞行员当时飞鸟还和他的父亲约定回来看他打棒球在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗飞鸟长大后加入了地球和平联合组织TPC在一次模拟战争中一举击败了超级胜利队的王牌飞行员由美村良然而此时他却遇到了宇宙球体斯菲亚虽然他驾驶战机奋力战斗却寡不敌众此时他看见了神秘的光成为了在这个世界里继大古后的第二个光之巨人的人间体