有一天主人公黑羽快斗得知8年前失踪的父亲――黑羽盗一就是怪盗基德父亲的失踪与一个黑衣组织有关为了查找那个组织的真相他继承了怪盗的职业和名字自己成为怪盗基德不顾生命危险想引出杀害爸爸的凶手在一次行动中他得知父亲的敌人――秘密组织在图谋长眠于大批珠宝中的可获长生的命运之石潘多拉为了粉碎他们的阴谋他现在以比组织更早一步找到潘多拉为目标因此他的主要猎物都是与宝石相关的东西